No se entiende muy bien cuando dices "Al abrir me sigue apareciendo esas bases de datos y no las que tengo en phpMyAdmin"
- Entiendo que las bases de datos que ves en PHPMyAdmin son las que tienes en la instalación de MySQL de Mamp
- Pero dices que al abrir te siguen apareciendo las bases de datos antiguas ¿pero abrir, dónde lo abres?
Si te refieres al conectarte por terminal, entonces tienes que usar el ejecutable correcto de MySQL que te ha instalado Mamp. Para ello creo que te va a ayudar esta FAQ: Usar el comando mysql en Mac con instalación de Mamp Server.
Si no es conectarte desde el terminal ¿dónde te refieres?
Luego otra cosa que seguramente tendrás que asegurarte es de no tener dos motores de bases de datos arrancados, porque te pueden causar problemas, o que solo arranque uno porque el otro no pueda por tener ya el puerto de MySQL abierto.
Así que igual podrías desinstalar tu base de datos de MySQL antigua, ya que si no te interesan esas bases de datos podrías desinstalarlo y ahorrarte problemas.