Existen múltiples posibilidades para el manejo de MySQL a partir de un interfaz web más visual que la cruel línea de comandos.
El más conocido es phpMyAdmin. Se trata en realidad de una aplicación escrita en PHP, con lo que resulta necesario que este lenguaje sea reconocido por tu servidor.
Puedes leer un inteesante articulo al respecto en este mismo sitio:
http://www.desarrolloweb.com/articulos/844.php?manual=6
Rubén Alvarez