No me queda claro, cuando te refieres que hiciste una conexión desde Visual Studio Code, ¿en realidad te refieres a que estabas programando un script en Javascript en Node que conectaba con la base de datos?
Porque VScode en sí no debería conectarte con la base de datos. ¿Quizás estás usando alguna extensión de VSCode que haga de cliente de la base de datos para verificar qué tienes dentro de las tablas?
- Si programas con Node, para conectar con base de datos estaría bien que indicases el código que estás usando para que podamos verificarlo.
- Si estás intentando conectar usando VSCode como cliente sería importante conocer la extensión que estás usando.
En el caso que estés usando una extensión de VSCode que no te funcione bien (ese error puede dar a entender que no está actualizada) prueba a usar alguno de estos Clientes de UI para bases de datos.
Si estás usando Node prueba a usar este package para conectar con MySQL que está más actualizado.