Realmente en algunos programas de transferencia por FTP el archivo .htaccess no se ve... debe de ser porque Linux trata como archivos ocultos todos los archivos que comienzan por un punto y estos programas simplemente los ocultan, aunque depende de tu configuración.
Así que, para ver el archivo .htaccess en tu programa de FTP tienes que hacer que se muestren los archivos ocultos. Yo también uso Filezilla y la versión que tengo instalada (3.2.2.1) hay una opción en el menú "Servidor / Forzar mostrar archivos ocultos" que debes de tener marcada para que puedas ver el .htaccess en el listado del directorio y que por tanto puedas descargarlo y hacer lo que necesites con el archivo.
Miguel Angel
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