Bajar las actualizaciones del proyecto es una operación que debes hacer de manera explícita:
git pull
No se bajará actualizaciones a no ser que tú lo digas, independientemente de lo que estés haciendo con el repositorio, creando ramas o cualquier otra cosa.
Al crear una rama, tal como se explica en el artículo de ramas en Git, el "working directory" del repostorio local no se cambia en absoluto. La operación en ese sentido es totalmente limpia con tus archivos de trabajo. Los deja tal como están por lo que no te tienes que preocupar por esa cuestión.
Después de crear la rama, podrás entrar en ella y hacer commit para enviar tus cambios actuales a la rama que acabas de crear.