La verdad que es sencillo (al menos en Access 2007), una forma que todavía no había probado. Simplemente haciendo una consulta de inserción sobre la tabla con el valor de ID que quiero ya está.
Ejemplo: TablaEmpresas con 2 campos: idEmpresa, idNombre. Siendo idEmpresa un autonumérico, y aunque ya hayas metido empresas, se puede insertar la siguiente con el número de identificador que desees con una consulta SQL. A partir de ahí el contador seguirá por el número que has introducido:
INSERT INTO TablaEmpresas VALUES (5500, "Empresa1")
Así pues, cuando sigas introduciendo datos desde un formulario o desde la vista de hoja de datos ya las siguientes empresas continuarán desde ese id: 5501, 5502, 5503...
Como podrás imaginar, si quieres establecer ese valor de inicio, lo único que tienes que hacer es insertar un primer registro en la tabla con un identificador igual al número que deseas que comience tu campo autoincremental.
Había leído un artículo de ayuda de Microsoft y lo hacía de una manera super rebuscada. Pero esta forma es totalmente sencilla.
Un saludo!