Creo que puedes tener diversos comandos que pueden realizar esto, depende de cómo se haya iniciado el servidor o la distro.
En mi caso lo hago con:
sudo systemctl reload nginx
También puedes forzar el rearranque de nginx con este comando:
sudo systemctl restart nginx
Por último puedes probar a parar y volver a arrancar:
sudo systemctl stop nginx
sudo systemctl start nginx
Pero en el caso que no estés usando systemctl, pueden ser otros comandos y aquí ya dependería de la configuración de tu servidor o incluso la distribución del Linux. Prueba si no te funciona alguna de estas posibilidades:
sudo nginx -s reload
sudo service nginx reload
sudo /etc/init.d/nginx reload
sudo /etc/init.d/nginx restart
sudo /etc/init.d/nginx stop
sudo /etc/init.d/nginx start
Seguro que alguna de estas alternativas te funciona, porque creo que las he cubierto todas... pero si encuentras alguna otra que me haya dejado, coméntalo.