Cómo separar una cadena de texto en PHP línea a línea

Una idea sencilla para separar una cadena de texto línea por línea en PHP es usar la función explode() con el separador de nueva línea "\n". Por ejemplo:

// Una cadena de texto con múltiples líneas
$texto = "uno@example.com
dos@example.com
tres@example.com";

// Separar los emails línea por línea
$lineas = explode("\n", $texto);

// Ahora puedes recorrer los emails si haces un recorrido al array $lineas
foreach ($lineas as $linea) {
    echo "<p>" . $linea . "</p>";
}

?>

Si lo que necesitas es además validar los emails de cada una de las líneas puedes usar la función filter_var con el filtro FILTER_VALIDATE_EMAIL. Lo tendrás que hacer para cada elemento de la línea, por ejemplo:

$texto = "uno@example.com
dos@example.com
no-es-un-email";

$emails = explode("\n", $texto);

// Verificar que cada línea sea un email
foreach ($emails as $email) {
    // quito los posibles espacios antes y después de la cadena, para asegurarme que no falla por eso
    $email = trim($email);
    // compruebo la validez de cada email
    if (filter_var($email, FILTER_VALIDATE_EMAIL)) {
        // email validado correctamente
        echo $email . " es un email válido.<br>";
    } else {
        // la validación de email no ha sido buena
        echo $email . " no es un email válido.<br>";
    }
}

El código anterior validará cada línea y mostrará si es o no un email válido. Con el bucle foreach y el condiciona conseguimos que, para cada línea de la lista de emails, te indique si el formato es de un email válido o no.