Hola. A ver si te puedo ayudar.
Luego de que subes el archivo seguro que muestras un mensaje "El archivo fue subido".
Bueno alli puedes agregar esto: Lo cual refrescara tu pagina automaticamente
//cierras php
?>
<meta http-equiv="pragma" content="no-cache">
<meta http-equiv="refresh" content="2;URL=?">
<?php //abres php de nuevo
El munero 2 es el tiempo de espera Y luego de URL= pones el nombre de tu script php actual (la página web que se está ejecutando), o dejas ese signo de pregunta que es lo mismo.
Ahora si usas un upload swf (flash) y puedes editar el archivo fla, debes buscar en el codigo alguna linea donde esta escrito el mensaje "Su archivo sue subido". Luego de eso pones un
getURL("tu script.php", "\_top");
Flash, mediante "getURL()" llamara a tu script con lo que se refrescara. y si usas ajax deberias hacer algo asi (al tener una respuesta):
window.location.href="tuscrip.php";
Espero haberte ayudado... Saludos...!