Los comandos generales tanto para servidores como para cliente de FTP por línea de comandos son los siguientes:
get: Para bajar ficheros
put: Para subir ficheros
lid: Especifica el directorio local sobre el que vamos a trabajar
cd: se utiliza para moverse a través de los directorios
delete: borra un fichero del servidor remoto
oppend: permite reanudar una descarga que haya sido interrumpida
open: abre una sesión en el FTP
close: termina la sesión con el FTP
bye: cierra la sesión y sale del programa de forma que todas las sesiones abiertas se cierran
ls: muestra el contenido del servidor remoto
mput: sube varios ficheros al servidor
mget: baja varios ficheros al ordenador local
user: sirve para cambiar el usuario con el que nos hemos conectado al FTP
bynary: nos sitúa en modo binario
ascii: nos sitúa en modo de ficheros de texto
Estos son algunos, para saber los parámetros y las distintas opciones solo tienes que ir a la ayuda de linux (man comando).